O Conselho Científico é o órgão deliberativo que tem por objetivo aprovar os planos e programas científicos e tecnológicos e a orientação geral do Centro de Estudos de Petróleo (CEPETRO), bem como supervisionar, orientar e apoiar no planejamento geral de suas atividades e compor a lista tríplice a ser encaminhada ao Reitor para escolha e designação do Diretor.
Seus membros reúnem-se ordinariamente uma vez por ano e, extraordinariamente, quando convocados pelo Diretor ou por um terço de seus membros.