O CEPETRO apóia o Programa de Pós-graduação em Ciências e Engenharia de Petróleo da Faculdade de Engenharia Mecânica (FEM) e do Instituto de Geociências (IG), através do convênio de cooperação com a Petrobras e do Programa de Recursos Humanos da ANP. O curso Ciências e Engenharia de Petróleo dispõe de bolsas dos organismos de fomento à pesquisa como CNPq, CAPES e FAPESP, além disso, conta com apoio de diversos projetos e programas de pesquisa como PRONEX, FINEP, CTpetro e outros.